瑚太郎接受了一份寻找新闻线索的工作,于是开始了在城市各处的奔走,在此过程中,只存在于都市传说之中的怪奇事件和神秘生物渐渐浮出了水面,与此同时,瑚太郎的身边亦发生了许多令他百思不得其解的怪事。为此,瑚太郎找到了超自然研究会的会长千里朱音(喜多村英梨 配音),希望后者能够解答他的疑惑,哪知道在两人调查的过程中,瑚太郎的一干好友纷纷被卷入了风暴之中。
天真无邪的智友和洒脱洒脱的慧丽为智友的初次体验而旅行。慧丽决心给尚为处男的智友一个良好的性教育。她给智友一个特殊的任务。这个任务就是和我在旅行中遇到的那个男人发生性关系。
为了防止犯罪团伙报复他,信义决定匿名并秘密追捕他们,希望能获得解药。有一天,新一的女友Maurilan来到阿里医生家,寻找她男朋友的下落。被小兰抓住的新一很快编造了自己的名字江户川柯南,然后柯南就和小兰在一起了。小兰的父亲森小五郎是一名私家侦探。新一可以利用他出去和他一起调查夜人的下落。柯南在小学时遇到了布美等小学生,他们一起组织了一支青年侦探队,向罪犯宣战!