丽华英（小松威子配音）是一个有着强烈正义感的年轻女孩。有一天，她搬进了月城庄的公寓，准备开始自己的生活。令住在202房间的Yuki惊讶的是，隔壁住着一个名叫Matsuoka Masato（由Masato Maeno配音）的牛郎。
无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 而暗地中，慕尼黑的一个神秘组织开始了寻找理想国“香巴拉”的仪式，连接炼金术世界与现实世界的“门”被打开了。 兄弟二人的命运与两个世界的危机交织在一起，爱力克兄弟要面对前所未有的挑战。
