故事发生在未来世界,一种名为“巨大”的生命体凭空出现,将人类的命运带到了灭绝的边缘。此时此刻,世界各国联合起来发明了可以与庞格竞争的武器,而只使用这些武器的女孩名叫莉莉。故事发生在财羽大学的科学研究室,Ichikage Acorus(田裕功配音)和雪村心月(上田雄马配音)是在这里工作的两名研究生。有一天,令辛叶惊讶的是,她收到了菖蒲的供词。