作品描述身为班长(委员长)、并且拥有完美主义的主角「北神未海」,虽然暗恋着问题三人组之一的「东条潮」,却因为不断有人搅乱导致她至今无法告白。未海因为自己的事情搞的手忙脚乱,另一方面还要帮助其他人解决烦恼、并给他们完美的建议,《極上!!めちゃモテ委員長》就是描绘这些发生在主角周围大小事的高中校园作品。
高中生小木健二是一个诚实内向的数学天才。一个夏天的一天,他被邀请到他姐姐夏Xi美丽的家乡野外工作。原来这份工作的内容实际上是一个伪装成夏Xi的男朋友。该家族的祖先是一个武士家族,他们与德川军团进行了激烈的斗争。