故事发生在一年的战争期间，与第一代高达的故事相似。前往地球前线工作的年轻联邦军官斯洛·山田在一次偶然的交火中遇到了敌人，基因军的女飞行员艾娜·萨哈林。
世界的中心，加特比亚，曾经是一个无尽而荒凉的恶魔王国。女神从天而降，天空中出现了一扇巨大的“门”。人们在“门”中发现了维持世界的奇迹之源；基里“；存在随着时间的推移，加特比亚发展成为一座城市。
佐藤玲子（由苍井优饰演）是一个没有任何技能的普通女孩。她刚从大学毕业，和父母住在一起，对自己的未来感到不知所措。她性格内向、固执，经常与家人发生冲突，最终决定工作并攒够钱搬出去，找到自己的生活。玲子没有食言。
