在危急的情况下，特勤局NERV的葛成美救出了真嗣，并在西本的指挥下将他带到了NERV的总部。但迎接真嗣的是他父亲的冷酷命令：驾驶一个名为“EVA”的巨大人形机器人与使徒作战。Shinji已经表示拒绝，在看到严重受伤的替补司机Ayumi后，他决定遵守父亲的命令。就这样，从未接受过作战训练的真嗣准备驾驶长荣第一架飞机对抗使徒。世界的命运交给了一个14岁的男孩，而隐藏在“第二次冲击”中的“人类完成计划”似乎也开始采取行动。掌握了所有答案的隐元都只是观察，没有任何动作，好像一切都已经写进了剧本。
太平时代，巍峨庄严的都城内，两大极道家族水谷组和吉田一家此消彼长，角力不止。水谷家大小姐雫（户松遥 配音）为将军之女大岛公主上私塾，通过知识的传授日渐巩固本组的势力，当然在此期间难免和吊儿郎当的少东家春之介（铃木达央 配音）率领的吉田一家难免冲突。与此同时，将军为了督促公主专心学习，在都城内颁布了禁止贩卖甜食的禁令，令百姓叫苦不迭。某天，雫因意外跌落河中，刚好被路过此地的春之介救了上来。两个青年男女开始了纯洁的交往，都城内的局势似乎也悄悄发生了些许变化…… 本片根据ろびこ的原作改编，为同名动画片的OAD版。
