《透明人与飞人》是一部由村山三郎执导的科幻电影。一个发现自己可以把人变成苍蝇大小的药的人开始为自己犯下战争罪的人报仇。为了把人们从飞人的恐怖中拯救出来，一位物理学家决定变得透明。
前战地摄影师雑贺辰己（高田裕司 配音）正在调查一宗议员谋杀案，误打误撞之中，他得到了女神——少女天王洲神乐（斉藤圭 配音）的吻，当他因拍下了女神容貌而被追杀的时候，辰己发现自己奇迹般的拥有了不死之身，而手中的相机，似乎也有了如同武器一般的强大威力。 长久以来，神乐都遭受着母亲天王洲神泉（高岛雅罗 配音）的虐待，成为女神，更是由于被催眠之故。于是，辰己带着神乐，利用自己“写杀”的异能力，开始了一段惊险而又刺激的逃亡之旅。
然后，在一个风雨交加的夜晚，在一位不速之客的攻击下，他们的关系朝着意想不到的方向发展
