外科医生Akira Okita（木村拓哉饰演）在海外完成了为期十年的研究和实验，带着丰富的经验和热情回到了他工作过的丹新纪念医院。尽管他在这里有过一些不愉快的回忆，但他现在比离开时更加自信和强大。
根据梅尔文在监狱留下的蛛丝马迹，兄弟二人前往西方的大国古雷达调查。在这里他们的火车遭到神秘黑蝙蝠的袭击，同时也遇到了梅尔文寻找的少女茱莉亚・克莱顿（坂本真绫 饰）。一番混乱之后，他们相继来到位于地下的贫困之镇米洛斯。米洛斯是大国夹缝中的牺牲品，而她的人民也决定利用圣星的利用重新复兴祖国与民族…… 本片根据荒川弘的漫画原著改编。
在剧场版第二章中被黑化后，小樱吸收了许多仆人的灵魂，被世界上所有的邪恶所控制，成为黑色圣杯的化身。最后，当得知所有出租车司机都放弃了成为同伴，选择保护樱花时
