父子和女人之间的关系纠缠不清。一家公司的女主管是一名白领，在被老板的弟弟骚扰和踢走后辞职。由于心情不好，男主角出去喝酒，他也在同一个地方喝酒。男主采取了行动，并成功地与女主发生了一夜情。女主角申请到男主角父亲的公司工作，并被男主角的父亲收留。
180年后，到了公元2356年，人类在地球、火星、土星、木星等各行星上都建立了巨大的宇宙基地，而为了在这些宇宙基地间建立有效的联络，在各行星之间还建立了许多太空站。在其中的一座空间站上有一座名叫“星之路”的宇宙学院，这座学院的任务就是培养有能力完成特殊任务的少年宇航员。本作的主人公片濑志麻就是这座学院中的一名学生。刚进入学院，片濑志麻和其他学员一样对新的学习生活很不适应，但同龄人之间的友情使大家都得到了不小的帮助，生活也渐渐进入正轨。片濑志麻还认识了一个名叫音山光太的男孩，两人很快就成为了好朋友。而且，一种朦胧的恋情也渐渐的在他们之间产生。平静的生活并没有维持多久，学员们开始接受严酷的训练，更有关系到地球存亡的重大任务让他们去完成，志麻和他的同学们能经受住这样的考验吗？
幕府时代末期，外忧外患，山川动荡。人民的生活很艰难，他们的生命不断受到威胁。年轻的心太被他善良纯洁的心所打动，成为了飞天剑流的大师。他被他招募来学习剑术，并改名为剑心。
