北银河正在举行冥界第一武术大会，孙悟空和来自西银河的排骨饭热战正酣。就在这时，冥界却出了乱子。阎王殿中，一名一心玩乐的小鬼不慎碰坏灵魂清洗装置，导致所有的邪气外泄，进而引发冥界巨大混乱。
在他自己的努力和王后梅洛玛的帮助下，尚文恢复了自己的声誉，获得了自己的领土，并为即将到来的浪潮做好了准备。然而，在梅洛马格以东的乌龟王国，可能带来前所未有灾难的恶魔——乌龟——已经复活。尚文接受了女王的委托镇压灵龟，团队将他们新加入的队友莱西娅带到了灵龟之国。随着联军的逐渐集结，乌龟王国国王的侧室——摄政公主奥斯特·蓬莱出现在尚文面前。尚文从她那里得知，灵龟是由人类以一种非传统的方式复活的。他们真的能压制住灵龟并揭露幕后主谋吗？
由于长距离子空间导航造成的时间和空间扭曲，导致人类返回的地方在20000年后变成了“地球””。在这个地球上，主人公庆南等人在被哥斯拉攻击的同时，与埃切弗族和比尔沙尔德族的外星人一起，实施了20年的“对抗哥斯拉的战术”，并通过一场致命的战斗成功击败了哥斯拉。但喜悦并没有持续太久。真正的哥斯拉“哥斯拉地球“隐藏在地下深处的东西出现了。在长达2万年的持续生长和生存过程中，青南和其他人在哥斯拉压倒性的破坏力面前分崩离析，哥斯拉进化成了这种姿态。拯救青南的人被认为是人类的残余，即米亚纳的富图阿人。富图阿是他们在地球上遇到的第一个人类。他们会是人类的后代吗。“福图亚之神也被哥斯拉打败了，现在只剩下鸡蛋了。挑战者和抗议者都被火焰吞噬了，消失了。”面对他们，庆南回答说，“这是用人手夺回地球的最后机会。”，注意到Fortuya使用的箭头是由“对金属体和纳米的自律思考”制成的，他很高兴。这是由与“机械哥斯拉”相同的材料组成的，他们在21世纪在富士山脚下开发了“对抗哥斯拉的决定性武器”，并在启动前被摧毁。这恰恰证明了当时的开发设备在今天仍然存在。
