故事发生在不久后的冬天。志莫林离开家乡山梨，在名古屋的一家小出版社工作，独自生活。一个周末，她正计划骑自行车旅行，但突然收到高中朋友大垣奇明发来的短信：“我现在在名古屋。
《屠杀器官》的舞台将设定在赛拉耶佛核爆后的地球，此时部分落后国家爆发了一连串内战及民族冲突，在这血腥风暴之中，美国特殊情报部队「克拉维斯（クラヴィス）」发现了在阴影之下有一名叫「约翰?保罗（ジョン?ポール）」的美国人参与其中，约翰路过之处必定掀起腥风血雨，这让众人疯狂的 「屠杀器官」到底是什么？ 剧场版动画《屠杀器官》根据早逝的天才科幻小说作家伊藤计划的同名小说改编，由富士电视台的noitaminA节目企划，manglobe制作，将于2015年10月上映。
童年的伙伴约书亚。你Xi！只要你有冲劲和毅力，你就可以做任何事情！... 真正地又是这样！？约书亚，你必须看起来更像一个贵族！“17岁的斯特拉，一个能干而冷静的士兵。永远不要失去微笑……因为微笑对生存至关重要。这是两个出生在遥远星球上的年轻女孩的故事。
