规则是魔术师与“灵魂”签订合同。所谓的“圣杯战争”允许获胜者获得圣杯以实现任何愿望。于是，七位魔术师和七位“英雄”加入了这场创造奇迹的战斗。Yumiya Shiro很清楚十年前的大灾难是由“圣杯战争”造成的。为了防止悲剧再次发生，他和他的“英雄”萨巴尔一起参加了这场危险而艰难的“圣杯战争”。
第三季的故事将讲述在前二季动画中，经过前所未有的激烈战斗后第三十届「QUEEN’S BLADE」最终结束。 前任女王，逢魔女王阿尔德拉被打败了，新一任的女王由雷云之将克劳迪特上任。 本身被公认是人格高尚的克劳迪特成为女王之后却性格大变，让整个大陆陷于战火的地狱之中。为了对抗这暴君的暴政及抹去人民的絶望，骑士公主安妮洛特便展开行动，与跟自己结成义姐妹的美斗士一起，扬起叛乱军的正义旗帜。安妮洛特与克劳迪特的战斗就此不可避免地终将展开，喜欢「女皇之刃」系列的大家又可以一睹众美少女战士的英姿了。
