由“国家组织CIRS”新设的特殊技能训练校“美滨学园”…… 因各种原因失去归所的少女们被交付的是，枪与实弹。 使用手枪的玲奈、擅长狙击的桐花、炸弹与信息处理的克莉丝、负责谍报活动的忍者邑沙季。 她们每天都以SORD成员的身份，处理警察及自卫队无法解决的事件，不断进行着危险的活动。 K县U港——。准备入国的重要人士突然消失了。 SORD成员开始调查失踪事件，但每当即将捕获消失的“行李”时，就会在还差一点的时候被其逃脱。 与姊妹校“京船樱丘”的SORD成员双子姐妹并肩作战，以及争执。 以及——在夜晚的城镇中疾奔的神秘女骑手“Soul Speed”·真纪的传闻——。 追踪最终转变成壮烈的死战，将身心一并撕裂。 ……但这同时还是，通往玲奈她们相遇之前的过去的旅程。
少女奈濑顺（水濑奇配音）有一个难忘的童年故事。有一次，作为一个年轻无知的女人，她缺乏克制导致了家庭的悲剧，她自己也被禁止说话。这种顺整天生活在悲伤中，与所有人保持距离，紧紧地关上了她的心门。
4月1日，俊勋许下了解除其特殊体质的愿望，但这个愿望代价高昂。4月1日，俊勋不得不在商店工作来偿还债务。在这里，他有一个强壮而矜持的白眼鬼，名叫静（中井和也配音），一个不幸缠身的葵（伊藤静配音），还有一个长相奇怪的宠物，名叫Makina。在工作的过程中，4月1日，俊勋遇到了一系列与愿望有关的事件。他发现，有好的愿望，有坏的愿望，也有简单的愿望，但也有无论如何努力都无法实现的愿望。人性、命运、必然性和偶然性都在店主一原裕子的控制之下。
