ヒャッコクジムのジムリーダー・ゴジカに勝利し、7つ目のジムバッジを入手したサトシ達は8つ目のポケモンジムがある街・エイセツシティに向けて、旅を続けていた。人类为了解开「兰道夫症候群」的原因、获得异形的DNA情报以及丰富的地下资源,人们纷纷前往深渊之中。