邪恶的天才科学家地狱博士（伊祖卡·云生配音）试图征服世界，导致人类陷入毁灭危机。在驾驶魔神Z（森喜朗配音）的斗嘉和其他同伴的努力下，世界得以恢复和平。十年后，窦嘉尔不再是超级机器人的司机，而是成为了一名科学家。
故事发生在秀之园学校，那里只有智商非常高的年轻女孩才能获得在这所学校学习的资格。在学校的学生会中，有一些精英甚至可以被认为是这所学校最好的学生之一。白银雨兴（沈谷川配音）是学生会主席。
故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。 （有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
