作为民间警备组织E.G.I.S.的一员工作的工藤优信，有着变身为泰迦，泰塔斯，风马这个3人的奥特曼的能力。经过与无数敌人的战斗，优信和泰迦之间的羁绊更加深厚。但是，他们现在却被什么人瞄准了。
长久以来，五个世界相互制约抗衡，形成了微妙的平衡，然而一场意外的发生让这五个世界都将面临着同一个结局——毁灭。 为了避免这恐怖的未来图景成为现实，拥有“Excceed能力”的少女们挺身而出，她们被送往名为青兰学院的学校之中，在这里接受训练和保护。率真耿直的彩城天音（田村由加莉 配音）、沉默寡言的苍月纱夜（寿美菜子 配音）、优雅高贵的阿尔玛利亚（原由实 配音），在校园里，这些命运相似的少女们相遇了。
Sunset Gowei是一个15岁的普通女孩，正在读初中三年级。有一天，她无意中通过家乡神社的枯井来到了500年前的战国时代。当到处都是狼和怪物时，地球上就充满了生命。葛伟在玉神木的住处遇到了被封印的半妖犬夜叉。
