Akashi Koji（安倍晋三饰）的父亲因举报企业内部的违法行为而被迫自杀，Koji的家庭也因此破裂。此时此刻，在儿童福利院工作的北村向兴慈伸出了援助之手。在他看来，只要他能保护好孩子，他就会毫不犹豫地犯罪。
可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
学园祭举办在即，大雄偶然瞥见静香和出木杉君练习《白雪公主》的话剧，他的心中充满嫉妒与怨恨。虽然知晓了真相，可是却担心最终能否和静香结为夫妻。为了排解他的忧虑，哆啦A梦带着大雄乘坐时光机来到未来。
