然而，医生仍然无法接受失去孩子的痛苦，也无法正确治疗阿童木，因为他认为阿童木不是人而抛弃了他。阿童木成了一个无家可归的流浪者，也被各地的军队通缉，最终被抓获。军方要求天马博士去除阿童木的能量，并将其转化为军用机器人的能源。在最后一刻，天马医生突然醒来，协助阿童木逃跑。面对军方的追击和拦截，阿童木奋起反抗，最终，一场惊天动地的战争迫在眉睫。在不断旅行的过程中，阿童木逐渐长大，他也接受了自己将机械与人类结合的设计，肩负起了全人类生存的责任。
当巴达克再次醒来，却发现自己躺在一颗与贝吉塔行星极其相似的星球上，身边环绕的则是一群从未见过的外星生物。种种迹象表明，巴达克似乎意外回到了久远以前的贝吉塔行星——普朗特行星。 正当他倍感困扰之际，邪恶的外星人袭击普朗特，他们是宇宙海贼齐尔德的手下，妄想统治普朗特并夺取具有神奇治愈能力的药物。冷酷无情的巴达克不可避免地卷入宿命的战争之中……
