现代社会之中，校园欺凌事件屡禁不止，成为学校和社会的难题。身材肥胖个性内向的有田春雪（梶裕贵 配音）便是长期欺凌的受害者。性格懦弱的春雪无法反抗欺凌者，唯有躲在网络之后，靠玩躲避球游戏来发泄愤怒。
那里，是威胁和平的人类之敌“恶魔党”大施淫威，与之对抗的Gatchaman率领的“科学忍者队”不停战斗的世界。 但，在对于这个世界的样子感到违和感的他们面前，一个男人的身影出现了。那是科学忍者队的创设者南部博士。对本应相识的健露出诡异表情的南部，向英雄们说出了意想不到的话语。“看来你们似乎是我的敌人”……。 此外，还有一个一直在楼顶窥视他们的身影。那是曾和健一同并肩对抗恶魔党的，科学忍者队No.2。 其名为“神鹰乔”。 四大英雄的全新激斗，将在银幕上拉开帷幕！
