《暗黑女子》改编自秋吉理香子的同名人气推理小说，描述了女子高中美少女白石逸美神秘死亡以后，逸美同校文学部的少女们，开始以她的死亡为主题，各自发表了检举犯人的作品。
天保二年冬天，运金船在越前鲭江藩海上遇难，附近黑崎村村民拾得金银，但不久后全村人离奇消失。 三年后浪人胁坂孙兵卫（仲代达矢 饰）遭人追杀，刺客正是孙兵卫当年的好友带刀所派，继而得知，村民消失事件将要再次发生。这背后究竟隐藏着什么样的秘密？
于是，担任第三侦察中队二级陆地卫队指挥官的宅男伊丹·尤西在帮助被巨龙袭击的村民的同时，与来自其他世界的美丽女孩，如精灵、法师和众神进行了精彩的交流
