在冲绳合宿中，在由于朝阳的云隙光而达到了最高氛围值的桥上，雪村和冰室进行了理论值最高的亲吻，但由于采集的唾液量并不充足，于是决定再次测量。为拜访唾液检测的专家，一行人动身前往理工部生命科学学院。
此后不久，特种部队冲进会场，救援行动顺利完成，导致巴中健在混乱中死亡。由于八重健的真正目的尚不清楚，而且在其被杀的过程中也存在谜团，杉田有京（水谷裕中饰）和神户（菊川光博饰）立即展开调查，发现这一切似乎与七年前的一次可能引发国际争端的恐怖袭击有关。另一方面，出于某种原因，高级警官不断施加压力，阻止专案组的调查。层层迷雾背后隐藏着什么惊人的真相？这部电影是同名电视剧的第二部剧场版。
2071年，随着超光速导航技术的实施，人类能够在太阳系内方便地移动。然而，由于设计错误，这项技术在月球上引发了爆炸，吸引了无数月球碎片飞向地球，造成了前所未有的灾难。幸存的人类逃离地球，开始在整个太阳系建立家园。
