在一个漆黑的夜晚，一名间谍悄悄潜入日本警察局，从记录了各间谍机构重要数据的绝密文件中窃取了绝密数据。日本警方和联邦调查局特工赤井水一（池田秀树配音）立即追捕这名间谍。最后，逃犯的车从悬崖上掉了下来。
夏目诚一经营着一家名叫Mellow的花店，他做着自己喜欢的工作，过着安稳的单身生活。有时候，夏目的姐姐会在她女儿不去上学的日子里把女儿寄养在他这儿，有时则会让濒临倒闭的拉面店店主木帆帮忙照顾。
现实对大雄来说总是很残酷，大雄并没因此而拥有强大的魔力，而且拥有魔毯是一件和奢侈的事情，而大雄家是支付不起的。另外，在这里，科学被视为迷信。著名的魔法研究者满月博士（中村正 配音）告知大家一个可怕的消息：魔界星不过多久便会完全接近地球。大雄想变回现实世界，但是“如果电话亭”早己被妈妈处理掉了。满月博士解读古文书后被捉走，逃亡的美夜子（小山茉美 配音）找到了大雄等人并得到他们的支持，大家一起出发至魔界星，解救博士…… 本片是哆啦A梦剧场版系类第一次用电脑图形CG绘画。
