卡卡西（井上和彦 配音）等人则负责侦查空之团的老巢，鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）、雏田（水樹奈々 配音）受命组成三人医疗小队，协助名医神农（石塚運昇 配音）前往其徒弟雨琉的家乡医治伤者。另一方面，病入膏肓的大蛇丸得知神农的再生之术业已完成，他命佐助（杉山纪彰 配音）前去寻找神农。这也促成佐助和昔日伙伴宿命的重逢…… 本片为《火影忍者》第五部剧场版动画。
逐渐习惯了高中生活的前暗黑破坏神少年Fujay Yong Tai（福山润配音）患有中学疾病，在外表和行为上都变得异常正常。然而，也许是命运故意开玩笑，导致他的周围挤满了中学生或潜在患者。
